[pyar] Problemas con hcluster
Alejandro Alvarez
alvarez.ciencia en gmail.com
Lun Mayo 7 07:01:25 ART 2012
Corrijo ...
Dist=Matriz_de_Distancias() # que es básicamente 1-Matriz de Similaridad
... (un error de jerga) :-)
El 7 de mayo de 2012 05:27, Alejandro Alvarez
<alvarez.ciencia en gmail.com>escribió:
> Saludos,
>
> He implementado un código para generar clusters en una serie de datos.
> Básicamente
> lo que hice fue generar una matriz de similaridad y de ahí en adelante es
> pan comido.
>
> el código para esa parte es básicamente el siguiente:
>
> DIST=Matriz_de_Similaridad()
>
> sqfrm = squareform(DIST)
>
> clustering = linkage(sqfrm, method='complete')
>
> R=dendrogram(clustering, labels=NODES, get_leaves=True)
>
> matplotlib.pylab.show()
>
> logro plotear el dendrograma, pero por mas que leo la documentación,
> no veo como obtener los clusters en formato dato, es decir, listas
> de etiquetas, con algún número que indique el nivel de similaridad
> en el que se unieron, o bien, todos los clusters formados en un nivel
> de similaridad dado.
>
> Si alguien tiene experiencia con python-hcluster o scipy.hcluster
> (pues entiendo que son básicamente el mismo proyecto), lo agradecería
> enormemente.
>
> Saludos Cordiales,
>
> --
> Alejandro J. Alvarez S.
> Master Student,
> Department of Mathematics
> Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas. I.V.I.C.
>
> Stochastic Dynamics Lab.
> Center for Physic.
> Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas. I.V.I.C.
>
> Telf. +58-212-5041919.
>
>
--
Alejandro J. Alvarez S.
Master Student,
Department of Mathematics
Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas. I.V.I.C.
Stochastic Dynamics Lab.
Center for Physic.
Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas. I.V.I.C.
Telf. +58-212-5041919.
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