[pyar] Problemas con hcluster

Alejandro Alvarez alvarez.ciencia en gmail.com
Lun Mayo 7 06:57:37 ART 2012


Saludos,

He implementado un código para generar clusters en una serie de datos.
Básicamente
lo que hice fue generar una matriz de similaridad y de ahí en adelante es
pan comido.

el código para esa parte es básicamente el siguiente:

DIST=Matriz_de_Similaridad()

 sqfrm = squareform(DIST)

clustering = linkage(sqfrm, method='complete')

R=dendrogram(clustering, labels=NODES, get_leaves=True)

matplotlib.pylab.show()

logro plotear el dendrograma, pero por mas que leo la documentación,
no veo como obtener los clusters en formato dato, es decir, listas
de etiquetas, con algún número que indique el nivel de similaridad
en el que se unieron, o bien, todos los clusters formados en un nivel
de similaridad dado.

Si alguien tiene experiencia con python-hcluster o scipy.hcluster
(pues entiendo que son básicamente el mismo proyecto), lo agradecería
enormemente.

Saludos Cordiales,

-- 
Alejandro J. Alvarez S.
Master Student,
Department of Mathematics
Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas. I.V.I.C.

Stochastic Dynamics Lab.
Center for Physic.
Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas. I.V.I.C.

Telf. +58-212-5041919.
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